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宁夏疾病预防控制中心作为省级疾控中心基本职责是：疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、实验室检测检验与评价、健康教育与健康促进、技术指导与应用研究。
中心于2002年7月由原自治区卫生防疫站、自治区地方病防治所和自治区劳动卫生职业病防治所整合组建。加挂“宁夏回族自治区地方病防治所”、“宁夏回族自治区性病艾滋病防治中心”、“宁夏回族自治区疾病预防控制科学技术研究中心”、“国家食品安全风险监测宁夏中心”牌子，是自治区继续医学教育培训基地、宁夏医科大学教学实习基地和自治区大学生校外实践教 学基地。
中心有6个业务所（疾病预防控制所、慢性非传染性疾病预防控制所、公共卫生所、职业病防制所、地方病与寄生虫病防制所、预防医学检验所），科室29个（职能科室8个、业务科室21个）。
中心现有编制237人，目前中心职工229名。在职人员中各类专业技术人员占92.6％；具有研究生学历的占31.4%；有高级职称的占34.1％；在全国及自治区各专业学术团体任职45人次。
中心是国家实验室认可和计量认证实验室，并具有国家食品检验机构资质，还取得8个省级技术资质认定，能够开展31个类别592项的检验检测项目。取得WHO和国家认证的实验室有4个，各功能实验室36个。
中心成立以来，共承担各级各类科研项目114项，共争取科研经费652.9万元。其中，自治区科技攻关项目11项85万元；自治区重点研发计划（一般项目）2项，经费21万；科技惠民项目1项60万元；自治区自然科学基金项目33项93万元；自治区新冠肺炎专项1项，300万元；承担国家自然科学基金项目1项32万；承担中国工程院院地合作项目字课题2项32万元；自治区卫生健康委课题63项29.9万元。
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