陕西省疾病预防控制中心是政府举办的从事公共卫生服务的公益性一类事业单位，是全省疾病预防控制工作的业务管理、技术指导、科研培训、质量控制中心。主要职责包括传染病、寄生虫病、非传染性疾病等的预防与控制；突发公共卫生事件及灾害疫情应急处置；疫情及健康相关因素信息管理；健康危害因素监测与干预；疾病病原生物鉴定和物理化学因子检测、评价；健康教育与健康促进；疾病预防控制技术指导与应用研究指导等。

中心成立于2001年11月，地址位于陕西省西安市碑林区建东街3号。人员编制216人，现在编在岗206人。其中，专业技术人员178人，占全部职工的86.4%。博士6人，硕士118人，合计占专技人员的69.7%。高级职称70人，中级职称68人分别占专技人员的39.3%、38.2%。享受国务院特殊津贴专家2人，陕西省“三五”人才2人。

中心内设机构20个。其中行政和后勤部门5个，包括中心办公室（学会办）、党委办公室、纪检监察室、财务部、总务部；业务部门15个，包括业务管理办公室、免疫规划所、传染病预防控制所（应急办）、病毒病预防控制所、艾滋病预防控制所、消毒与病媒生物防控所、计算机信息与网络中心（医学图书馆）、慢性非传染性疾病预防控制所、营养与食品安全风险监测所、环境健康研究与评价所、病原微生物与生物检验所、理化检验所、毒理检验与评价所、放射与职业卫生所、鼠疫与布病预防控制所。

中心拥有全自动微生物鉴定系统、核酸序列测定仪、流式细胞仪、全自动核酸提取仪、实时荧光定量PCR仪、电感耦合等离子质谱仪、原子吸收分光光度计、原子荧光分光光度仪、离子色谱仪、气相色谱仪、气相-质谱联用仪、高效液相色谱仪、液相-质谱联用仪、全自动生化分析仪等大型精密仪器设备300余台（套）。

有十万级净化实验室10个，负压生物安全二级实验室10个，常压生物安全二级实验室12个，PCR实验室6套，应急检测车（BSL-2）一辆。拥有屏障环境动物房500平方米，普通环境动物房200平方米。

拥有国家实验室认可证书和国家级检验检测机构资质认定证书，是WHO认证的脊灰、麻疹确证实验室，艾滋病确证省级中心实验室，全国食品安全风险监测评估陕西中心实验室，国家疟疾检测参比实验室，PulseNet China陕西省区域中心实验室，特殊食品验证评价技术机构，化妆品注册与备案检验机构。

中心先后获得全国科学大会奖2项，参与完成国家科技进步奖一等奖1项，卫生部科技进步一等奖1项，卫生部科技进步二等奖2项，国家安全标准成果三等奖1项，国家安全标准成果四等奖1项，中华医学科技奖2项，陕西省科学技术一等奖1项，陕西省科学技术二等奖9项，陕西省科学技术三等奖9项，陕西省科学技术奖（不分级）11项，中国实验动物学会科学技术三等奖1项。

近年，中心先后荣获国家卫生计生委“全国疾病预防控制工作先进集体”，人社部、国家卫生计生委、国家中医药管理局“全国卫生计生系统先进集体”，陕西省委、省政府“陕西省先进集体”等荣誉称号。因新冠肺炎疫情防控中的突出表现，2020年9月，中心荣获中共中央、国务院、中央军委“全国抗击新冠肺炎疫情先进集体”，中心党委荣获中共中央“全国先进基层党组织”。