动物摄取的日粮养分中，只有一部分被动物吸收，用于其生长和繁殖，其馀养分随排泄物进入人的环境，随排泄物进入环境的微生物也很多，其中有病原微生物，家畜粪污不适当处理对外排放，对周围地表和地下水、土壤、大气、人的健康造成很大威胁。

　　(1)粪污对地表和地下水的危害养殖粪污和污水废弃物在其贮藏、处理和利用过程中，有可能通过泄漏或径流进入地表和地下水体，带入的氮磷增加水体浓度，水生植物和藻类增生，地表水体营养丰富，地下水质参数超标。

　　(2)粪污对土壤的危害土壤污染主要来自家畜粪便长期过度施用，家畜粪便中的养分(氮、磷、钾)、药物残留和重金属等在土壤中积累，地下水硝酸盐污染、地表水磷污染、农作物中的重金属和其他微量元素超标。家畜粪便是农田中重金属负荷的重要来源，锌、铜等金属影响作物的生长和发育障碍，含有作物减产的锌污水灌溉农田，对作物特别是小麦的生长产生很大影响，小麦出苗不均匀，分析少，植物小，叶子萎黄

　　(3)粪污对大气环境的危害是家畜II便和养殖污水的1C:在保存和处理过程中产生大量氨、硫化氢、甲硫醇、甲硫醚、二硫醚、丙酸、丁酸、戊酸等臭气物质，引起臭气污染。不仅如此，比利时、荷兰、丹麦等欧洲国家的研究表明，畜牧业排放的氨气是引起酸雨的主要因素。《中华人民共和国气候变化初期国家信息通报》显示，1994年中国温室大棚气体总排放量为36.50亿吨二氧化碳当量，其中动物粪便管理过程中排出的氧化亚氮15.5万吨，动物粪便管理过程是重要的农业大棚气体排放源。

　　(4)粪污生物风险畜禽养殖废弃物中含有大量细菌、病毒、寄生虫等病原微生物，许多微生物离开动物后迅速死亡，但部分微生物在适当条件下生存，土壤中生存时间长，对动物和人类健康有很大威胁。