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北京延庆区疾控中心（北京市延庆区疾病预防控制中心、延庆区职业病诊断鉴定委员会办公室）是一家经国家卫生部门批准成立的一家集医疗、临床、预防、保健、科研于一体的预防、职业卫生检测、环境检测等项目综合性公立疾病预防控制中心，是从事基本公共卫生服务的公益性事业单位。
北京市延庆区疾病预防控制中心成立于2005年4月1日，是隶属于北京市延庆区卫生和计划生育委员会的事业单位。中心占地面积12429平方米，建筑面积6117平方米。拥有气相色谱-质谱联用仪、离子色谱仪、流动注射分析仪、全自动毛细管电泳仪、全自动酶免分析仪、实时荧光定量PCR扩增仪、全自动生化分析仪、全自动微生物鉴定系统等各种检测设备200余件。目前，已通过了北京市技术监督局计量认证，能够依法开展各类卫生检验、监测、疾病预防控制及科研培训工作。
2020年9月，被中共北京市委、北京市人民政府评为：北京市抗击新冠肺炎疫情先进集体。
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