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海南省疾病预防控制中心是实施国家级疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的卫生事业单位。直属于海南省卫生厅， 2010年7月27日升格为副厅级事业单位。2007年通过了第一次监督评审，技术水平和能力达到了国内先进水平，质量管理程序符合世界贸易组织（WTO）规则要求，检验检测结果获得了国际认可，确立了中心在全省检验检测领域的优势地位。
中心内设9个处级部门，16个科级部门。现有工作人员235人，专业技术人员占职工总数的84.2%；中高级技术职称人员占48%；其中本科学历者占70.3%，研究生占9.3%；博士占 8.4%。国家及省级优秀专家15名，卫生部有突出贡献中青年专家2名。
中心现有办公和实验场所面积16398平方米，其中实验室使用面积为6500平方米。现已拥有18个具有国内先进水平的实验室，设有生物安全防护二级（P2）实验室、千级（局部百级）洁净实验室等。2006年获得中国国家认证认可监督管理委员会授予的计量认证证书和中国合格评定国家认可委员会授予的实验室认可证书，并于2007年通过了第一次监督评审，技术水平和能力达到了国内先进水平，质量管理程序符合世界贸易组织（WTO）规则要求，检验检测结果获得了国际认可，确立了中心在全省检验检测领域的优势地位。
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