北京市疾病预防控制中心（北京市预防医学科学院、北京结核病控制研究与防治所），是根据《中共北京市委机构编制委员会关于市卫生健康委和市中医局所属事业单位改革有关事项的批复》（京编委〔2021〕120号），在原北京市疾病预防控制中心、北京市预防医学研究中心、北京市结核病控制研究所基础上，于2021年5月重新组建的北京市卫生健康委直属公益一类事业单位。
北京市疾病预防控制中心贯彻执行国家和北京市有关疾病预防控制工作的法律法规和政策，制定全市疾病预防控制专业计划、技术方案、卫生标准和干预措施，并组织实施。为北京市制定公共卫生法律法规、政策、规划、项目等提供技术支撑、情报信息、综合研判和咨询意见，组织实施国家和全市免疫规划工作。
承担着北京市传染性疾病、慢性非传染性疾病、学生常见病、病媒生物传播疾病等预防与控制，开展疾病监测与预警和疾病流行规律研究；承担全市传染病疫情溯源和调查处置，突发公共卫生事件和灾害疫情应急处置；开展健康危害因素监测与干预工作，开展食源性、职业性、放射性、环境性等疾病的监测评价和流行病学调查，开展公众健康和营养状况监测与评价，提出干预策略和措施；承担全市结核病预防与控制；同时还肩负着首都重大政治、经济、社会活动的公共卫生保障、首都生物反恐怖袭击应急等任务；开展公共卫生与疾病预防控制的基础性和应用性科学研究与科技创新，促进科研成果转化。
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